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很荣幸这两所大学本人都多次去过，而且多年深度接触过两所学校的毕业生，为此我说说个人的看法和感受。
两所学校都很优秀，是国内顶级大学，但学校的定位是完全不同的，华中科技大学的定位是培养工程师的地方，而中科大是培养科学家的地方。因此，从社会影响力和口碑完全不同的，进入学校直观了解到的学风和校风也是不一样的，华科大对学生强调的动手能力，工科是学校的强项，中科大对学生强调的是科学研究能力，以理科见长。
从学校隶属来说，华科大隶属于教育部，中科大隶属于中国科学院，是两个不同方向的定位，教学研究型，一个是科研型。
从学校生源来说，华科大每年招生人数较多，工科和医学很多。中科大一直保持小而美少而精的路线，理科为主，单个学生的水平更加优秀，仅次于清北，有些学生能力超过清北，而且每个人有很独特。
从实际投入来说，华科大产学研结合的非常优秀，国家拨款和社会捐赠以及学校实际项目非常多，比较有钱。中科大是一所科学研究基地，国家拨款非常多，注重基础教育和研究，更多站在底层理论研究出发，论文影响力和质量较高。
从区位地点来说，华科大所在中国教育重镇武汉，高校林立，竞争激烈，教育环境优越，交通便利，产业环境比较好。中科大所在中部地区合肥，比较安静，适合做学问，没有那么繁华，也多了一些务实。
所以，如果从用人单位角度考虑，看需求选择目标学校，中科大本科生基本非常少的毕业，多数是出国深造为主，研究生很多都是其他外校考过来的，一般学历一般，所以科大硕士水平并不高。华科大本科毕业生相对科大多一些，但大部分优秀的同学也已经保研或者考研，去了国内其他顶级大学，硕士很多是本校或者武汉地区其他学校居多，平均水平略高。如果找工科方向，华科大更适合，如果偏向研究型中科大更适合。
如果是考学的话，中科大会更加优秀，分数如果能够达到，进入中科大是更加好的选择。
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