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个人建议选择西北农林科技大学，理由如下：
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第一，从专业的角度上来看，动物医学这个专业，扬州大学和西北农林科技大学都非常厉害，特别是扬州大学这所双非大学，却在动物医学领域拥有雄厚的实力。我们来看学科评估结果:
从学科评估上来看，扬州大学的动物医学被评为A-，排名全国前4名，学科建设得非常不错。
当然，西北农林科技大学作为一所传统的农业大学名校，动物医学专业自然也不差，B+的水平也是很不错的。
第二，从学校的综合实力上来看西北农林科技大学是一所985名校，位于陕西著名的农业重镇杨凌，而西北农林在农业类大学里拥有非常高的地位和影响力，拥有一大批资深的名师专家，这些的虽然受到地域影响，但学校浓厚的科研氛围，扎实的学习，一直为业内所佩服。
而扬州大学是一所位于古城江苏扬州的重点大学，但却属于一所双非大学，非985也非211，只是合并进来的扬州农学院实力非常强，合并后，很多人都不一定知道扬州大学的农学类专业是强项。
第三，个人建议对于考研来说，既要选学校也要看专业，综合起来看，显然是西北农林科技大学的实力要更适合读研。虽然地理位置不佳，但它强大的学校实力，足以弥补专业上跟扬州大学的差距。
如果扬州是所211大学的话，那个人肯定建议选择扬州大学。但扬州大学的实力跟西北农林科技大学差距有点大，显然选择扬州大学有点吃亏。
以上纯属个人意见，仅供参考。
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